Следы неизвестной древней популяции нашли в геноме современных людей

В некоторых случаях на долю «наследства» может приходиться больше 1% генома.

Ученые обнаружили в геномах современных людей фрагменты ДНК неизвестной древней популяции. Наши предки, предположительно, смешивались с представителями этой популяции в Африке еще до начала расселения Homo sapiens по другим континентам.

Для анализа около 500 человеческих геномов ученые разработали инструмент TRACE. Он ищет участки ДНК, попавшие в геном в результате скрещивания разных человеческих линий. Оказалось, доля неизвестного древнего наследия в отдельных геномах составляет от 0.5% до 1.1%.

Сначала TRACE проверили на известных фрагментах ДНК неандертальцев и денисовцев: точность системы превысила 90%, доля ложных результатов оказалась ниже 0.25%. После этого программа выявила ранее неизвестное наследие, суммарно охватывающее почти 1.5 миллиарда оснований — это около половины полного генома человека.

Следы загадочной популяции обнаружились у всех изученных групп современных людей. Именно это указывает на смешение до выхода Homo sapiens из Африки. При этом у африканских народов сохранилось больше разнообразных последовательностей, а около 100 участков с такой ДНК отсутствуют у людей из других регионов.

Исследователи считают, что неизвестная линия ДНК отделилась от предков современных людей более 800 тысяч лет назад. Найденные фрагменты короче неандертальских и денисовских, поэтому они, вероятно, дольше присутствуют в геноме Homo sapiens.

Ученые также нашли крайне редкие следы еще более древней линии ДНК, отделившейся почти 1.8 миллиона лет назад. Часть ее ДНК могла попасть к жителям Океании через денисовцев.

Пока исследователи не могут определить, кем были представители неизвестной африканской популяции и давали ли унаследованные от них варианты ДНК какие-либо преимущества. Некоторые обнаруженные участки расположены рядом с генами, связанными с иммунитетом и обменом веществ.